南京市工商联宝应商会成立于2010年3月，2014年7月经南京市发改委批准，由南京市民政局注册登记，更名为南京市宝应商会。商会现办公地址在南京市秦淮区胭脂巷１４－3号，2023年商会人员共158人。其中名誉会长2人，荣誉会长1人，会长1人，执行会长１人，监事长1人，常务副会长6人，副会长10人，秘书长1人，执行秘书长1人，理事37人（含领导班子），会员130人，顾问23人。下设商会办公室、财务部、审计部、宣传部，互助发展部、会员服务部、监事会。2017年５月，商会党支部正式成立。
近几年，在市工商联的领导下，在市工商联会员处的业务指导下，经过广大会员的共同努力，商会一年一个台阶，取得了可喜的成绩。2015年被南京市工商联、南京市总商会评为五星级基层商会；2016年被江苏省工商业联合会、江苏省总商会授予“全省工商联商会组织先进集体”；2016、2017年，连续两年被南京市发展改革委员会授予“在宁异地商会先进单位”；2018年1月，被南京市工商联、南京市总商会授予“四好示范商会（优秀五星级商会）”；2019年3月被江苏省工商联授予“四好商会”；被南京市民政局评定为“3A级社会团体组织；2021年1月，被全国工商联授予2019年---2020年全国“四好商会”荣誉称号。
